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张明, 王彩惠, 郑宇馨, 江左其杲, 侯叶茂, 曹鹏, 戴情燕, 杨若薇, 刘峰, 冯晓恬, 莫林恒, 付巧妹. 2024: 古DNA准确鉴定湖南老司城遗址残缺头骨以及东亚豹母系遗传历史新见解. 动物学研究, 45(1): 226-229. DOI: 10.24272/j.issn.2095-8137.2023.292
引用本文: 张明, 王彩惠, 郑宇馨, 江左其杲, 侯叶茂, 曹鹏, 戴情燕, 杨若薇, 刘峰, 冯晓恬, 莫林恒, 付巧妹. 2024: 古DNA准确鉴定湖南老司城遗址残缺头骨以及东亚豹母系遗传历史新见解. 动物学研究, 45(1): 226-229. DOI: 10.24272/j.issn.2095-8137.2023.292
Ming Zhang, Cai-Hui Wang, Yu-Xin Zheng, Qi-Gao Jiangzuo, Ye-Mao Hou, Peng Cao, Qing-Yan Dai, Ruo-Wei Yang, Feng Liu, Xiao-Tian Feng, Lin-Heng Mo, Qiao-Mei Fu. 2024. Ancient DNA unravels species identification from Laosicheng site, Hunan Province, China, and provides insights into maternal genetic history of East Asian leopards. Zoological Research, 45(1): 226-229. DOI: 10.24272/j.issn.2095-8137.2023.292
Citation: Ming Zhang, Cai-Hui Wang, Yu-Xin Zheng, Qi-Gao Jiangzuo, Ye-Mao Hou, Peng Cao, Qing-Yan Dai, Ruo-Wei Yang, Feng Liu, Xiao-Tian Feng, Lin-Heng Mo, Qiao-Mei Fu. 2024. Ancient DNA unravels species identification from Laosicheng site, Hunan Province, China, and provides insights into maternal genetic history of East Asian leopards. Zoological Research, 45(1): 226-229. DOI: 10.24272/j.issn.2095-8137.2023.292

古DNA准确鉴定湖南老司城遗址残缺头骨以及东亚豹母系遗传历史新见解

Ancient DNA unravels species identification from Laosicheng site, Hunan Province, China, and provides insights into maternal genetic history of East Asian leopards

  • 摘要: 老司城遗址位于湖南湘西土家族苗族自治州,是南宋绍兴五年(1135年)至清雍正二年(1724年)永顺彭氏土司的政治、经济、军事、文化中心。该考古遗址出土了大量动物骨骼,对了解清代中期以前该地区动物群体组成提供机会,但出土动物骨骼的准确鉴定是深入研究的基础。在发现的1万多例可鉴定骨骼标本中,有2例残缺的哺乳动物头骨存在较大的争议。为了解决这一争议,我们首先使用micro-CT技术对残缺头骨进行扫描并对形态数据进行分析。结果表明2个动物头骨的听泡和乳突特征与猫科(Felidae)动物的形态特征存在高度相似性,因此CT扫描结果认为这两个头骨应归属于猫科动物。然而由于头骨的残缺,形态学鉴定无法做出进一步明确的物种鉴定结果。在这种情况下,我们使用古DNA方法成功获取了2个头骨样品的高质量线粒体全基因组数据。系统发育和遗传距离分析的结果均显示这2个动物头骨来自于华北豹(Panthera pardus japonensis)。此前,国际自然保护联盟(IUCN)猫科动物专家组将华北豹划归到了东北豹(P. p. orientalis)。然而该研究的结果显示东亚地区的东北豹、华北豹和华南豹(P. p. delacouri)被明确划分为三个不同的亚群,分别与东亚北部、中部和南部的地理位置相对应。通过线粒体基因组数据的突变率推算,发现东北豹、华北豹和华南豹的分化时间约为15.5万年前。这些发现为东亚地区豹的母系遗传历史提供了新的见解。考古学证据表明在约300-600年前,湖南老司城遗址周边的豹种群还相当丰富,这与现今豹种群的分布存在很大差异。种群历史分析表明,豹的有效种群规模在过去3万年中一直呈下降趋势。过去几个世纪以来豹种群的快速下降则更可能是受到人类活动的影响。

     

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