1 500年前壳DNA揭示深海白瓜贝（双壳纲：囊螂科）的系统发育地位

Phylogenetic context of a deep-sea clam (Bivalvia: Vesicomyidae) revealed by DNA from 1 500-year-old shells

摘要: 软体动物贝壳里的古DNA保存了古代生物多样性和物种进化信息，但这种可能性尚未使用深海软体动物贝壳进行验证，尤其是处于极端化能合成环境下的软体动物贝壳。南沙伴溢蛤（Archivesica nanshaensis）是一种只在南海2 626米水深的海底发现过空壳的深海冷泉白瓜贝。在该研究中，我们从中国南海东北部3 003米深海采集到三对1 500年前生活的南沙伴溢蛤贝壳，提取了壳DNA进行Illumina高通量测序，最终组装了该物种的线粒体与核基因片段。研究结果显示，南沙伴溢蛤与同样分布于南海的囊螂科姐妹种Archivesica marissinica有明显的遗传差异，其线粒体细胞色素c氧化酶亚基I基因（COI）序列的K2P遗传距离达到3.4%，经化石时间校正的物种分歧时间估算结果表明二者至少在850万年前于中新世已产生分化。该研究揭示了基于高通量测序的壳DNA技术在深海软体动物进化研究中的潜在应用价值。