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Conserved sequences identify the closest living relatives of primates

Mei-Ling Zhang Ming-Li Li Adeola Oluwakemi Ayoola Robert W. Murphy Dong-Dong Wu Yong Shao

Mei-Ling Zhang, Ming-Li Li, Adeola Oluwakemi Ayoola, Robert W. Murphy, Dong-Dong Wu, Yong Shao. Conserved sequences identify the closest living relatives of primates. Zoological Research, 2019, 40(6): 532-540. doi: 10.24272/j.issn.2095-8137.2019.057
Citation: Mei-Ling Zhang, Ming-Li Li, Adeola Oluwakemi Ayoola, Robert W. Murphy, Dong-Dong Wu, Yong Shao. Conserved sequences identify the closest living relatives of primates. Zoological Research, 2019, 40(6): 532-540. doi: 10.24272/j.issn.2095-8137.2019.057

利用全基因组保守序列确认现存灵长类的最近姐妹支系

doi: 10.24272/j.issn.2095-8137.2019.057

Conserved sequences identify the closest living relatives of primates

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    Corresponding author: Dong-Dong Wu,Yong Shao
  • 摘要: 阐明现存灵长类近亲的系统发育关系对于深入理解灵长类(特别是人类)基因组和遗传表型进化等相关生物学问题至关重要。然而,目前灵长类近亲的系统发育关系仍然存有较大争议,形态学和分子生物学证据普遍支持三种主要的假说:(1)树鼩是灵长类的姐妹进化支系;(2)树鼩和皮翼类共同作为灵长类的姐妹进化支系;(3)皮翼类是灵长类的姐妹进化支系)。在本研究中,我们使用两种序列划分策略(45 Mb全基因组保守非编码元件和393 kb串联蛋白编码基因序列;它们分别代表不同进化速率的基因组区域)来探讨上述三种假说的正确性。相比于其它系统发育分子生物学研究,本研究评估了灵长类及其近亲的基因组进化历史,该结果稳固地支持第三种假说—皮翼类是现存灵长类的最近姐妹进化支系。同时,我们的系统发育研究表明猴亚科基因组(特别是狒狒族)具有较低的核苷酸分歧水平,而长臂猿基因组拥有较高的核苷酸分歧速率。此外,我们使用MCMCtree方法进一步更新了灵长类小目以及灵长类早期进化支系的分歧时间。
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出版历程
  • 收稿日期:  2019-03-30
  • 录用日期:  2019-08-06
  • 刊出日期:  2019-10-14

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