染色体10q24.32区域中一个精神分裂症风险相关的339-bp Alu插入的功能研究

杨智辉; 蔡欣; 瞿娜; 赵丽娟; 钟宝亮; 张淑芳; 陈静; 夏玢; 姜红燕; 周丹阳; 刘伟鹏; 常宏; 肖潇; 李毅; 李明

doi:10.24272/j.issn.2095-8137.2020.014

染色体10q24.32区域中一个精神分裂症风险相关的339-bp Alu插入的功能研究

Identification of a functional 339 bp Alu insertion polymorphism in the schizophrenia-associated locus at 10q24.32

摘要

摘要: 迄今为止的全基因组关联分析研究鉴定到许多与精神分裂症发生风险密切相关的单核苷酸多态性变异（SNP）和小片段插入缺失位点，但人们对其中功能变异及其参与疾病发生的机制仍知之甚少。通过研究与精神分裂症显著相关的染色体10q24.32区域中的遗传变异，我们发现其中存在一个长度为339-bp的多态性Alu（rs71389983）插入变异，且该Alu与精神分裂症风险变异rs7914558完全连锁。通过体外双荧光素酶报告基因实验，我们发现该Alu序列的存在强烈抑制了基因的转录活性，表明其很可能通过影响基因表达参与疾病的发生，且可能成为未来研究精神分裂症生物学机制的一个切入点。同时，我们的结果也证实此类在前期研究中多被忽视的多态性变异可能在精神分裂症发生中起到重要作用，提示未来针对精神分裂症的遗传学研究应给予此类变异更多的关注。

Abstract: Genome-wide association studies (GWAS) have identified multiple single nucleotide polymorphisms (SNPs) or small indels robustly associated with schizophrenia; however, the functional risk variations remain largely unknown. We investigated the 10q24.32 locus and discovered a 339 bp Alu insertion polymorphism (rs71389983) in complete linkage disequilibrium (LD) with the schizophrenia GWAS risk variant rs7914558. The presence of the Alu insertion at rs71389983 strongly repressed transcriptional activities in in vitro luciferase assays. This polymorphism may be a target for future mechanistic research. Our study also underlines the importance and necessity of considering previously underestimated Alu polymorphisms in future genetic studies of schizophrenia.

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